天津新增的第137例病例全基因组测序结果是怎样的?
年6月22日从天津市疾控中心获悉,经天津市疾控中心对本市第137例确诊病例呼吸道标本的新冠病毒全基因组高通量测序和序列分析 ,中国疾控中心复核,确认与北京新发地市场相关病例的病毒序列完全相同,属于L基因型欧洲家系分支I。
月17日 ,天津市新增1例本土新冠肺炎确诊病例,为天津的第137例确诊患者 。但奇怪的是,患者未出天津 ,未接触确诊者,无疑似病例和确诊病例接触史。
高测序深度:可以提高数据的准确性和可信度,减少测序误差和偏差 ,有助于发现低频突变或变异,提高复杂基因组区域的解析能力。低测序深度:可能导致某些区域的覆盖度不足,出现“低覆盖度区域 ”,从而影响测序结果的准确性和完整性 。
read过短会掩盖很多基因组水平整体上的信息 ,分析到的结果更倾向于散乱。测序深度如何选取 测序深度与测序覆盖度为正相关,应根据实验设计来判断。在群体遗传学的一些研究中,可采用低测序深度方法 。